Jag skulle släppa din kod i den grundläggande php-5.3 applikationsskelett och gå därifrån.
Du kan lägga till mysql till vilken applikation som helst genom att ange den som ett beroende när du skapar rhc app create steg, eller genom att skriva rhc cartridge add mysql från din lokala projektrepo-mapp.
När du får allt att fungera, skulle jag överväga att publicera den resulterande repan till GitHub. Detta bör tillåta andra att spinna upp din openshift-kompatibla kopia av Kohana genom att köra:
rhc app create kohana php-5.3 mysql --from-code=http://github.com/YOUR_ACCOUNT/YOUR_PROJECT_NAME.git
(med YOUR_ACCOUNT och YOUR_PROJECT_NAME ersättas med kommandot ovan)