Efter att ha googlat runt kunde jag hitta en gammal (2009) relaterad fråga på Django Google-grupperna :
För att lösa problemet, ändra funktionen så att den blir ungefär så här:
def some_func(input):
#kill old database connection
from django.db import connection
connection.close()
#code inserting data into Django here
pass
Då fungerade det bra.