Använd lsof -i TCP:3306 eller netstat -lp | grep 3306 för att ta reda på vad som redan lyssnar på port 3306 - något måste lyssna på den.
Du kan överväga att stirra servern på en annan port (redigera my.cnf och ändra standardporten där).
Du kan behöva köra detta som root, dvs sudo lsof -i TCP:3306