Att lägga till främmande nyckel till befintlig tabell ger felet 1050 tabell existerar redan

Jag fick samma fel, och det berodde på att den främmande nyckeln redan fanns. Vad du vill är bara att lägga till begränsningen:

ALTER TABLE Registration 
  ADD CONSTRAINT idx_Registration_CustomizationSet 
  FOREIGN KEY (customization_set_guid) 
  REFERENCES CustomizationSet(customization_set_guid);