Fick precis ett svar från Fixies team:
När jag frågade om möjligheten att använda SOCKS för det här fallet svarade de:
Så tydligen, i mitt fall, finns det inget sätt att upprätta en anslutning till MongoDB Atlas-klustret med mongoose genom proxylösningen som erbjuds av Fixie (Heroku-tillägget).