Mongodbs webbplats har dokumentation för vad du ska göra (endast i en nödsituation) när du behöver konfigurera om en replikuppsättning när medlemmarna är nere . Det här låter som den situation du befinner dig i.
I grund och botten, om du använder version>=2.0, och det är en nödsituation, kan du lägga till force: true till replica set-konfigurationskommandot.