Uppdatera :Med WiredTiger, compact gör ledigt utrymme.
Det ursprungliga svaret på denna fråga är här:Minska MongoDB-databasfilstorleken
Det finns verkligen ingenting utanför repair som kommer att återta utrymmet. Den compact bör tillåta dig att gå mycket längre på det befintliga utrymmet. Annars måste du migrera till en större enhet.
Ett sätt att göra detta är att använda en offline-sekundär från din Replica Set. Detta bör ge dig ett helt underhållsfönster att migrera, reparera, flytta tillbaka och ta upp igen.
Om du inte kör ett replikset är det dags att titta på att göra just det.