Dela upp det innan du lägger ihop allt med DISTINCT. Det är naturligtvis bättre att normalisera dina data (högst 1 värde i en kolumn)
SELECT
GROUP_CONCAT( DISTINCT SUBSTRING_INDEX(SUBSTRING_INDEX(keywords, ',', n.digit+1), ',', -1)) keyword
FROM
t
INNER JOIN
(SELECT 0 digit UNION ALL SELECT 1 UNION ALL SELECT 2 UNION ALL SELECT 3 UNION ALL SELECT 4 UNION ALL SELECT 5 UNION ALL SELECT 6) n
ON LENGTH(REPLACE(keywords, ',' , '')) <= LENGTH(keywords)-n.digit
WHERE cid=28