Jag skäms ganska mycket, men ifall det finns någon annan där ute och möter något liknande på grund av hans/hennes dumhet,
felet berodde på att mappen delades mellan windows och linux, och bundler hade körts på windows tidigare. När de var på ubuntu plockades de tidigare installerade Windows-biblioteken upp, istället för de inbyggda linux-biblioteken. Rensa vendor/cache löste problemet