Problem med att generera en lista i python och lagra den i en mysql-databas

Det verkar som att du skriver över dina listor istället för att lägga till dem när du gör:

for site in sites:
    items = [site.select('//h2').extract()]
    item = [site.select('//h3').extract()]
    meta = [site.select('//meta').extract()]

Jag tror att du kanske vill ändra det till:

for site in sites:
    items.append(site.select('//h2').extract())
    item.append(site.select('//h3').extract())
    meta.append(site.select('//meta').extract())