välj att uppdatera med distinkt mysql

UPDATE table AS t
  JOIN table AS tt
    ON t.initials = tt.initials
     AND t.surname = tt.surname
     AND t.company = tt.company
     AND t.id > tt.id
SET t.active = 1;

Det vill säga, uppdatera den för varje rad om det finns en annan rad med ett lägre id, med samma initialer, efternamn och företag.

Här är en sqlfiddle för det.