Jag vet att det här är nästan ett år efteråt, men om någon är i din situation och letar efter rätt svar.
När du har två separata datatyper länkade av en tredje tabell, letar du efter Sequelize's BelongToMany(Through).
Så i ditt fall skulle du behöva definiera en tredje modell:UserMaster. Du skulle ge UserMaster två attribut:user_id (samma som PartnerTxn-attributet) och ägare (samma som Account-attributet).
Då skulle du göra så här:
Account.belongsToMany(PartnerTxn, {through: 'UserMaster'});
PartnerTxn.belongsToMany(Account, {through: 'UserMaster'});
För ytterligare referens, dokumentationen har information.