har du tittat på pentahos vattenkokare (eller pentaho dataintegration)? http://kettle.pentaho.org/
vi använder den för att kopiera över och hålla synkroniserade olika databassystem, såsom mssql<->mysql, vilket verkar vara det du efterfrågar.
kettle är till och med kraftfullare än så, vilket gör att du kan söka efter ldap-databaser, raka textfiler, etc...
dess diagramverktyg liknar i utseende och känsla Microsofts dts (men mer kraftfull, imho)