Att infoga i index i allmänhet dödar prestandan. Det kan vara bättre att ta bort indexet innan du infogar data och indexera om efter infogningen.
Från http://forum.percona.com/s/m/983/ :
Kolla även in http:/ /www.mysqlperformanceblog.com/2007/05/24/predicting-how-long-data-load-would-take/ och http://www.linuxtopia.org/online_books/ database_guides/mysql_5.1_database_reference_guide/insert-speed.html .