AFAIK, det finns inget naturligt sätt att fly för MySQL regex. Du kan göra det i PHP med preg_quote (http://www.php.net/manual/en/function.preg-quote.php) som förmodligen skulle göra jobbet åt dig, men uppenbarligen inte är designat för ändamålet.
Mitt föredragna sätt om jag var i din situation skulle vara att konstruera en regex-vitlista i PHP som du sedan kan tillämpa på din farliga sträng:
$safeString = preg_replace('/[^\w]/','',$dangerousString);
Detta tar bort alla icke-ordstecken (dvs allt utom A-Za-z0-9_) från din sträng.
OBS! Jag tror att de andra svaren inte kommer att ta bort/undkomma regex specialtecken, vilket jag tror är ditt krav.