Jag hade samma problem. Jag fick reda på att den första instansen du öppnar bara fortsätter att snurra när du försöker köra enkla valda uttalanden utan något som verkar vara någon anledning. Du kan inte ens stänga fliken när den väl är öppen utan att stänga hela MySQL Workbench. Men om du öppnar samma instans igen verkar det fungera bra.