Varningen från mysqltuner.py är faktiskt relevant även om din cache inte riskerar att bytas ut. Den förklaras väl i följande:http://blogs.oracle.com/dlutz/entry/mysql_query_cache_sizing
I grund och botten spenderar MySQL mer tid på att sköta cachen ju större cachen är och eftersom cachen är mycket flyktig även under måttliga skrivbelastningar (frågor rensas ofta), kommer det att ha en negativ effekt på din applikations prestanda om den är för stor. Justera query_cache_size och query_cache_limit För din applikation, försök att hitta en brytpunkt där du har flest träffar per infogning, ett lågt antal lowmem_prunes och håll noga koll på att dina databasservrar laddas samtidigt som du gör det.