MySQL Workbench körs på Windows och Linux. Den kommersiella versionen låter dig bakåtkonstruera och redigera strukturen i en livedatabas, med den gratis som du först måste dumpa strukturen till en fil. Dess förfader DBDesigner är lite äldre, men har inte denna begränsning. Windows och Linux också.
Om dessa två är överdrivna kan du prova med HeidiSQL , ättling till MySQLFront. Den körs endast på Windows, men det finns en alfaversion som körs på Java.