Jag har faktiskt lyckats lösa detta själv. Här är den uppdaterade koden
CREATE TRIGGER `incremental_before_ins_tr` BEFORE INSERT ON `incremental`
FOR EACH ROW
BEGIN
SET NEW.source = (Select source from crm_record
where crm_record.msisdn = new.msisdn order by dat DESC limit 1);
END;
Jag behövde ange tabellnamnet före kolumnvärdet på rad 5.