Du måste redigera din my.cnf fil och se till att porten är inställd som på följande rad:
port = 3360
Starta sedan om din MySQL-tjänst och du bör vara igång. Det finns ingen fråga du kan köra för att göra denna ändring eftersom port är inte en dynamisk variabel (q.v. här för MySQL-dokumentation
visar en tabell över alla systemvariabler).