Du kan helt enkelt lägga till WHERE
klausul till UPDATE
. Mer om det i oracle docs.
Så i ditt fall bör det se ut så här:
...
WHEN MATCHED
THEN
UPDATE
SET tgt.column3= src.column3,
tgt.column4 = src.coulmn4
WHERE tgt.column3 IN (val1, val2)
WHEN NOT MATCHED
...