Det enda sättet som kan hända är att MariaDB hade en bugg eftersom när en Tx modifierar en post, kommer den att låsa den tills den begår eller återställs. Andra Tx skulle blockera UPPDATERING på grund av lås men tillståndet måste omvärderas efter att låset har släppts.
Försök att byta till READ_COMMITTED och se om det löser problemet. Det kan vara en REPEATABLE_READ-avvikelse.