Det vi till slut gjorde var att använda sqlalchemys händelsemekanism för att fånga frågorna innan de körs och lägga till ett prefix för att ändra schemat:
def before_cursor_execute(conn, cursor, statement, parameters, context, executemany):
schema_name = <Logic to resolve schema name>
statement = "SET search_path TO '%s'; %s" % (schema_name, statement)
return statement, parameters
......
(later in the code)
listen(Engine, 'before_cursor_execute', before_cursor_execute, retval=True)
På så sätt kan vi köra alembics migrering flera gånger, se till att schema_name löses korrekt varje gång och att allt fungerar smidigt