TRUNCATE måste skapa en ny (tom) fil för tabellen, vilket förmodligen orsakar ditt problem. Du kan DROP tabellen och återskapa den.
Ett annat, mer besvärligt sätt skulle vara
DELETE FROM table_name;
VACUUM table_name; -- no FULL!
Medan VACUUM normalt inte krymper tabellen, den kommer att trunkera tomma sidor från slutet av tabellen. Om tabellen är tom tar det bort alla sidor.