Artikeln "Making Schema Changes on Publication Databases" bör täcka det mesta du behöver veta. Till skillnad från äldre versioner av SQL Server bör du bara kunna göra DDL-ändringarna (förutsatt att du inte har avaktiverat standardinställningarna för replikering).
Som artikeln nämner kommer du inte att kunna använda SSMS för att göra dessa ändringar.