Det fungerade med
EXEC xp_cmdshell 'C:/.../python.exe C:\...\script.py';
GO
Ett problem är att du måste använda en .exe i xp_cmdshell, så bara med kommandot python fungerar det inte, du måste använda python.exe. Ett annat problem var att python-skriptet måste finnas i datorn som körs skriptet, tidigare var skriptet på en gemensam server, men det nekade tillståndet, och när skriptet ändrades från katalogen till den här servern fungerade det!