Använder du lower_case_table_names = 2 i din MySql (my.ini ) konfiguration? Då har du förmodligen stött på denna bugg:
https://github.com/phpmyadmin/phpmyadmin/issues/11816
Du kan prova att nedgradera till en äldre version av phpmyadmin t.ex. 4.4.15.2 tills felet är åtgärdat.