phpMyAdmin som kommer med cPanel (i 3rdparty-katalogen) är tydligen säkrad med cpanel-autentiseringen, så svaret är "nej".
Du kan installera din egen phpMyAdmin (kanske är den till och med tillgänglig i script-center/one-click-installer) och ställa in den för att direkt autentisera på MySQL-servern med din anpassade MySQL-användare eller bara låta din användare ange sina referenser som du har tillhandahållit.