Du behöver en aggregeringspipeline som matchar varje underdokument separat, och sedan åter sammanfogar de matchande underdokumenten till arrayer:
from pprint import pprint
from bson import Regex
regex = Regex(r'ab')
pprint(list(col.aggregate([{
'$unwind': '$docs'
}, {
'$match': {'docs.value': regex}
}, {
'$group': {
'_id': '$_id',
'docs': {'$push': '$docs'}
}
}])))
Jag antar att "col" är en variabel som pekar på ditt PyMongo Collection-objekt. Detta ger ut:
[{u'_id': u'1',
u'docs': [{u'key': u'5678', u'value': u'abgh'}]},
{u'_id': u'0',
u'docs': [{u'key': u'1234', u'value': u'abcd'},
{u'key': u'5678', u'value': u'abef'}]}]
"r"-prefixet till strängen gör den till en Python "rå"-sträng för att undvika problem med regex-kod. I det här fallet är regexet bara "ab", så prefixet "r" är inte nödvändigt, men det är bra praxis nu så att du inte gör ett misstag i framtiden.