Förutom gregors svar kommer användningen av Guids för närvarande att förhindra användningen av det nya aggregationsramverket eftersom det representeras som en binär typ. Oavsett så kan du göra vad du vill på ett enklare sätt. Detta låter mongodb bson-biblioteket sköta omvandlingarna åt dig.
public class MyClass
{
[BsonRepresentation(BsonType.String)]
public Guid Id { get; set;}
}