Problemet är att din fråga inte är giltig JSON eftersom den innehåller JS-uttryck som ska utvärderas (dina beräkningar med datum).
Så du måste i princip göra ett skript eller göra lite skalakrobatik som genererar frågan JSON innan du skickar den till mongoexport
Du kan hitta denna användbar länk som gör precis det med python
Dessutom gjorde jag (quick &dirty) något liknande med node, dvs skapade en fil query.js med detta innehåll som i huvudsak skapar din fråga JSON och skriver den till konsolen
var oid = Math.floor(new Date(new Date().getTime() - 1000 * 60 * 15) / 1000).toString(16) + "0000000000000000";
console.log('{ "_id": { "$gte": new ObjectId("' + oid + '") } }');
så att du nu kan använda den i ditt skal som så
mongoexport ... --query "$(node query.js)" ...
Hoppas det hjälper