Jag kan inte hitta några dokument som täcker detta enkla fall så jag kan se varför du har problem. Men det är så enkelt som att använda en $set
med en nyckel som använder punktnotation för att referera till det inbäddade fältet:
OrganizationModel.update(
{name: 'Koka'},
{$set: {'address.street': 'new street name'}},
callback);