För närvarande (MongoDB 3.2) aggregering stöder inte executionStats, med förklara-alternativet i aggregering får du en del data relaterad till frågan men det finns ingen executionStats i den. Det föreslås och du kan kontrollera dess status här
https://jira.mongodb.org/browse/SERVER-19758
Rösta upp frågan om du vill implementera detta snart.