Jag tror att det finns någon standardkonfiguration som saknas i den här versionen av mongoDb-klienten. Försök att köra:
mongo 127.0.0.1:27017
Det är konstigt, men sedan har jag upplevt att problemet försvann :) (så det enkla kommandot 'mongo' utan några params började fungera igen för mig)
[Ubuntu Linux 11.10 x64 / MongoDB 2.0.1]