Om detta var en engångsoperation skulle jag göra:
use DB;
show table status name where engine='innodb';
och gör en rektangulär kopiera/klistra in från kolumnen Namn:
+-----------+--------+---------+------------+-
| Name | Engine | Version | Row_format |
+-----------+--------+---------+------------+-
| countries | InnoDB | 10 | Compact |
| foo3 | InnoDB | 10 | Compact |
| foo5 | InnoDB | 10 | Compact |
| lol | InnoDB | 10 | Compact |
| people | InnoDB | 10 | Compact |
+-----------+--------+---------+------------+-
till en textredigerare och konvertera den till ett kommando
mysqldump -u USER DB countries foo3 foo5 lol people > DUMP.sql
och importera sedan efter att ha ersatt alla instanser av ENGINE=InnoDB
med ENGINE=MyISAM
i DUMP.sql
Om du vill undvika den rektangulära kopierings-/klistramagin kan du göra något som:
use information_schema;
select group_concat(table_name separator ' ') from tables
where table_schema='DB' and engine='innodb';
som kommer att returnera countries foo3 foo5 lol people