#1066 - Inte unik tabell/alias:

Du verkar välja från samma bord två gånger. Var och en av dessa förekomster behöver sitt eget alias:

SELECT
    l.url
FROM
    b as b1 /* <-- */
    INNER JOIN links as l
      ON b1.parent_id = l.id
    INNER JOIN b as b2 /* <-- */
      ON l.id = b2.link
WHERE l.url LIKE 'http://domain%' LIMIT 0, 30

Observera att jag också har lagt till det saknade aliaset l för links bord.