Att endast använda PHP skulle vara ganska besvärligt, du måste hämta alla poster från din mysql-tabell, skapa lämpliga tabeller i sqlite3 och infoga posterna.
Så vitt jag kan säga vill du bara göra det automatiskt, så jag skulle inte se skadan med att använda skalprogram. Du kan ganska enkelt göra detta med exec
funktion:http://nl3.php.net/manual/en/function .exec.php