Autocommit hjälper dig inte här, start transaction åsidosätter det.
De hängande transaktionerna kommer att rullas tillbaka så snart anslutningen går ut ELLER klienten återansluter, beroende på vad som inträffar först.
Det finns inget sätt att begå en dinglande transaktion, det enda möjliga alternativet är en återställning.
Om du vill förstå InnoDB-statusutdata, se:
http://www.mysqlperformanceblog.com/2006/07/17/show-innodb-status-walk-through/