Det ser inte ut som att mysqlimport kan läsa från STDIN men du kan kanske experimentera med en namngiven pipe . Något liknande detta (otestat)
mkfifo bigfile
mysqlimport -uuser -ppassword Database bigfile &
cat genome | nawk > bigfile
Eller så kan du använda ett tillägg att bash för att köra kommandon istället för filer
mysqlimport -uuser -ppassword Database <(cat genome | nawk)