Tja $company->employees
returnerar en samling, ->id
är inte en egenskap i samlingen, det är därför du får felet.
Om du vill hämta en array som innehåller alla id:n för dina anställda kan du göra så här:
$company->employees()->lists('id');
Om du läser detta och använder laravel ^5.3.*
då skulle svaret vara:
$company->employees()->pluck('id');
Detta skulle returnera en samling med alla id:n, om du vill att det ska vara en array kan du kedja ->toArray()
bakom det.