Okej, jag lyckades hitta en "ren" lösning, med hjälp av codeigniters join, set, etc. Så det som är coolt är att du kommer att ha alla CI:s fördelar med att använda $this->db->join(), $this->db->join(), etc. som att fly och lägga till citattecken.
Så gör först alla dina CI-grejer:
$this->db->join(..) // Set all your JOINs
$this->db->set(..) // Set your SET data
$this->db->where(..) // Set all your WHEREs
Sedan kan du bygga frågan med hjälp av Active Records färdiga, rensade och undanröjda frågeelement:
// JOIN
$sql = "UPDATE $this->baseTable ";
$sql .= implode(' ', $this->db->ar_join);
// SET
$sql .= ' SET';
$setArray = array();
foreach ($this->db->ar_set as $column=>$newValue)
array_push($setArray, " $column = $newValue");
$sql .= implode(',', $setArray);
// WHERE
$sql .= ' WHERE '.implode(' ', $this->db->ar_where);
$this->db->query($sql);
Om någon har en bättre lösning tar jag gärna emot den och använder den istället