Du bör behöva ställa in datum och tid. Kolumnen create_at kommer automatiskt att uppdateras till den aktuella tidsstämpeln vid infogning. Se dokumentationen på Automatisk initiering och uppdatering för TIMESTAMP .
Ditt uttalande ska vara
cursor.execute("""INSERT INTO temps VALUES (%s,%s,CURRENT_TIMESTAMP)""",(avgtemperatures[0],avgtemperatures[1]))