Du kan använda vilken fråga som helst i pdo som du kan använda i mysql direkt men ditt sätt att göra det är att motverka syftet med att använda PDO i första hand, du bör formulera frågan som
$q = $pdo->prepare("SELECT * FROM $tablename WHERE field = :field AND param IS NOT NULL");
$q->execute(array('field' => $field));