Så det här är det enklaste sättet jag har hittat... Inte säker på varför jag inte tänkte på det här från början... men jag undertryckte helt enkelt varningarna från markören:
import warnings
warnings.filterwarnings("ignore", category = MySQLdb.Warning)
Jag la sedan till den här koden i min importMySql-funktion:
mycursor.execute("SHOW WARNINGS")
warnings = mycursor.fetchall()
for i in range(len(warnings)):
print "Warning - " +warnings[i][2]