Istället för att välja alla fält med "SELECT *" bör du uttryckligen namnge varje fält du behöver, alias dem med AS efter behov. Till exempel:
SELECT si.field1 as si_field1,
si.field2 as si_field2,
ind_data.field1 as ind_data_field1
FROM sites_indexed as si
LEFT JOIN individual_data as ind_data
ON si.id = ind_data.site_id
WHERE `url` LIKE :url
Och sedan kan du referera till aliasnamnen i din resultatuppsättning.