Du bör egentligen antingen konvertera all data till en gemensam enhet (säg bytes) eller lägga till en kolumn som innehåller en "måttenhet" och hålla själva storlekskolumnen numerisk.
Med det sagt bör följande fungera på data som slutar med antingen GB/MB/KB eller B.
select size
from t
order
by case when size like '%GB' then power(1024, 3) * substr(size, 1, length(size) - 2)
when size like '%MB' then power(1024, 2) * substr(size, 1, length(size) - 2)
when size like '%KB' then power(1024, 1) * substr(size, 1, length(size) - 2)
when size like '%B' then substr(size, 1, length(size) - 1)
end desc;
+-------+------------+
| size | bytes |
+-------+------------+
| 1GB | 1073741824 |
| 10MB | 10485760 |
| 100KB | 102400 |
| 1000B | 1000 |
+-------+------------+