Det du verkligen behöver är ett bord för akademierna, ett för kurserna och en relationstabell där du kan lagra många-till-många-relationerna. Jag lämnar till dig frågan för att få det resultat du letar efter :)
CREATE TABLE academy
(
academy_id int(11) not null auto_increment,
name varchar(25) not null,
primary key (id),
);
CREATE TABLE course
(
course_id int(11) not null auto_increment,
course_name VARCHAR(50) NOT NULL ,
primary key (course_id),
);
CREATE TABLE accademy_course
(
academy_id int(11) not null,
course_id int(11) not null ,
primary key (academy_id, course_id),
foreign key (academy_id) REFERENCES academy (academy_id) on delete cascade,
foreign key (course_id) REFERENCES course (course_id) on delete cascade
);