Jag har loggat in på en mysql-loggtabell med en cron som knackar den.
Jag använder vanligtvis innodb tabeller i mina appar, men för loggtabellen gjorde jag det som myisam och använde insert DELAYED . . . frågor.
Myisam tillhandahåller inte alla godsaker från innodb, men jag tror att det är något snabbare (av den anledningen).
Det viktigaste du är orolig för är databaslåsning när din cron körs, men att använda "insert delayed" kommer runt det problemet för det mesta.