Ditt problem är mer än troligt att vissa Linux-distros har olika php.ini's för Apache PHP och och PHP-CLI, det verkar som om din PHP-CLI (som kakbakaren kommer att använda) inte har mysql_*-funktionerna aktiverade.
För att fixa det måste du hitta php.ini för PHP CLI och avkommentera raden som innehåller mysql_* lib. bör vara något i stil med "extension=mysql.so". För att hitta platsen för php.ini, kör php -r 'phpinfo();' på kommandoraden och scrolla till toppen för att se platsen för php.ini.