Som teresko säger är MySQL-namn skiftlägeskänsliga på *NIX-plattformar och okänsliga på Windows. Om du utvecklar kod för att stödja båda (som jag gör) kan en blandning av dina fall orsaka enorm huvudvärk:dumpa till exempel en databas på Windows och återställ den till *NIX och alla dina fall går förlorade. Vi var faktiskt tvungna att kludga kod för att upptäcka och fixa fallen på en dump bara av denna anledning.
Om du är fri från Windows spelar det ingen roll vad du använder, så länge du håller det konsekvent.